在淘宝店卖别人申请专利的商品，现在被告停止侵权该怎么办？

专利被其他公司侵权后，首先要进行证据的搜集，这样后面的措施才会有主动权，证据包括：专利权属证据、侵权存在证据、赔偿金额证据。可以采取三种方式维权，包括：1.协商，双方可以自行协商或在第三方的调解下达成和解，可向侵权方发送警告函，告知事项，并使对方重视该专利侵权的重要性；2.行政救济，专利权人掌握充分侵权证据后，可向专利局行政部门举报，行政部门核查后，可对侵权人采取行政处罚；3.司法救济，专利权人可以向侵权发生地、被告所在地的人民法院提出诉讼，要求对方停止侵权和进行赔偿等。
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专利侵权的行为人应当承担的民事责任形式主要有停止侵害、赔偿损失、消除影响。
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侵犯专利权，被侵权人可以向法院起诉要求侵权人承担侵权责任，承担侵权责任的主要方式包括停止侵害、赔偿损失等。因为侵犯专利权造成的损失可以参考《最高人民法院关于审理专利纠纷案件适用法律问题的若干规定》中相关规定。